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主题:[请教一个化学问题]计算气体的摩尔数 -- 青方

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  • 家园 [请教一个化学问题]计算气体的摩尔数

    真心求教一个普通的化学问题,一个封闭的玻璃管,容量是19ml,内含有5% CO2,95% O2,在一个大气压下,温度37摄氏度,管里还有1 ml的缓冲液,液体里含24 mM的NaHCO3,pH 7.4,问这个管里有多少摩尔的CO2 ?

    • 家园 谢谢各位,再说清楚点

      试验是这样的,Kreb's buffer,含NaHCO3 24 mM,预先调整pH到7.4,先把细胞转移到在试管底部,然后加1 ml buffer,用橡皮塞封口,然后用针头注入5% CO2和95% O2,用另一个针头保持气体的出口,这样置换掉管中原来的空气,所以气压不增高,然后拔除针头,保持密闭状态。再在37度水浴中摇2小时。因为buffer 里加入了13C-glucose,所以试验结束的时候,取管中气体测定13CO2的比例(APE)。问题是在不测定CO2总量的情况下,理论上讲这个CO2的摩尔数是可以计算的。

      我的化学知识都忘的差不多了(本来学的就少)。两种想法,第一是否可以把管中的气体按照理想气体计算,这样的话,1 mole 气体=22.4L,管中气体的容积是18ml,0.018(L)/22.4(L)=0.0008 mole=0.8 mmole,CO2是5%,0.8(mmole)X0.05=0.04mmole=40umole。假定2小时后气体和液体中的交换保持到平衡状态,且还是24mmole/L,所以总CO2的量就是40.024 umole。但感觉好象不对。

      另一个是按照idea gas law,PV=nRT=NKT,但这几个参数如何选择,我就不清楚了,几位能否给指教一下。例如P,按照标注气压,是101.3 KPa, V是0.018L,n 是要计算的摩尔数,R是否是8.3145? T是温度,是310.15k。是不是可以这么算?

      • 家园 CO2一定会与你的buffer交换的

        在这个封闭系统里,如果不考虑细胞作用,CO2会迅速的溶解在你的溶液里,改变pH值,当然也同时改变气相的压强和气相CO2的总量。因此在你做测定的时候,气相里已经没有5%的CO2了。

        而且看你的设计,目的似乎是要测定细胞代谢产生的CO2。你之所以能够通过对气相13CO2的测定来估计细胞产生的CO2,也就是因为存在气相和液相间的气体交换平衡。而你的初始状态显然不是平衡态,所以当你封闭系统的时候,整个系统就开始往平衡态移动,2小时虽然未必会达到平衡,但也肯定不是初始态。

        在正常的细胞培养里,用的是自动控制的CO2培养箱,CO2是连续的通入系统的,所以可以保持气相里有稳定的5%CO2与液相保持平衡。在你设计的这个实验里,由于封闭了CO2的来源,气相里的CO2会被迅速的溶解,实验开始不久之后,气相里的实际CO2浓度就取决于液相的实际pH值和从CO2到CO32-到HCO3-的各种不同形式的CO2的浓度,而且这个平衡是受温度以及压强影响的,不是那么好算。唯一可以肯定的是气相的CO2不是5%,压强也肯定略有变化。

        此外,取决你的培养规模大小,细胞制造CO2的速度未必会很低。高密度的细胞培养制造的CO2,在数小时之内就可以高到使得溶液显著的酸化。当然如果细胞量很小,这个影响应该可以忽略。

        如果一定要知道管内有多少气态的CO2,必须做实验才行。倒不是不可以算,只是你的系统是个多变量平衡的系统,有溶液里的碳酸盐平衡,有CO2溶解平衡,有因为溶解造成的压强变化,还有细胞活动,所以是很难算的。如果只是要知道CO2加碳酸根形式的CO2的总量,那么楼下jufeng的思路是对的。

        • 家园 buffer不是白用的。

          C12,和C13的交换是必然的。

          在PH=7.84NaHCO3下,CO2不会很快的进行交换。

          所有CO2相关物种,都将会以HCO3-形式存在,这就是为什么要使用BUFFER的原因。

          CO2在气相中的量应该是基本不变的。

        • 家园 献花
        • 家园 谢谢,分析的很好!

          所以和以往14C的数据比较,计算出来的是偏高了。所以计算的数并不能实际应用,只是大概评估一下试验是否运转正常。

          这个buffer的pH稳定于7.4,气液交换是在一个平衡状态。

          谢谢分析,设计试验的时候,并没有太关注13CO2释放的问题,但最后决定试试,结果GC-MS对分析13CO2非常敏感,APE的值看着很不错,只是没有测定CO2的总量,大概估算一下,还说的过去。

          • 家园 我看了楼下jufeng的回复,觉得他的思路是对的

            根据制造培养基的惯例,我们可以算出初始的碳酸根携带的CO2总量为0.24umol,气态的是你算的40umol,加起来是40.24umol。

            假如在2小时里整个系统达到近平衡态,那么无论在液相还是气相里,碳12和碳13二氧化碳的比例应该都是一样的,因为同位素的化合物的多数理化性质是相近的。

            所以在你做GS—MS的时候,只要得到13CO2和12CO2的比例,再利用初始的CO2总量,解一个小方程,就可以求出细胞活动造成的CO2总量。

            x/0.00004024=13CO2/12CO2

            注意细胞开始应该用13C葡萄糖处理过足够时间,全细胞的碳源差不多都给取代了才行。这样新增加的13CO2理论上都是细胞在2小时里的代谢活动造成的。否则的话就不好说了,因为细胞也可能在分解原有碳源的基础上产生12CO2。

            • 家园 不过,补充一下,液态对气态的交换也不是那么快

              很明显的一点是在培养箱里养细胞的时候,细胞密度高的话,培养基会明显的酸化,这说明新制造的CO2并没有有效的交换到气相去。这个现象的原因是由于气体交换的面积有限,一则培养皿都是盖了盖子的,只是有限通气,二则即便不盖盖子,液体的表面也很有限,未必能有效换气。

              在你的情况里,首先,试管里的液体与气相的界面不是很大的;其次,虽然是不断的摇动,但是我怀疑既然是细胞培养,摇动可能不会很剧烈。因此我怀疑在你的实验里,2小时内,溶液里的CO2和气相的CO2并没有平衡,也就是说细胞制造的13CO2不会很有效的交换到气相里去。液相的13C:12C一定高于气相的13C:12C。所以光量气相的13C:12C,用来算细胞代谢的话,我觉得结果会严重的偏低。

              关于解决这个问题的方法,除了同时测气相与液相的13CO2:12CO2外,我还有个不是太完美的主意:结束实验的时候,把体系在80C处理一段时间,一则杀灭细胞,二则促进液相与气相的气体交换。这样量的13CO2:12CO2也许会更准确的反应整个体系的情况。

      • 家园 就化学问题讲

        我不懂生化。就化学问题讲,条件不很明确。

        细胞产生的CO2是不是很多,如果很多,会影响体系的压力。没有压力值,无法解。

        如果假设压力不变,考虑到5%这种一位有效数字的精度,反应结束时的CO2含量仍可任为是5%不会产生很大的错误。而且在37C这种条件下,可适用理想气体。CO2的摩尔数计算如下:

        PV=nRT n=(101.3x0.018)/(8.314x310)=0.7mmol

        0.7mmolx5%=0.035mmol

        • 家园 很对!

          细胞产生的CO2很少,基本是pmol水平,对压力的影响不大,所以这样算还算合理,最好的办法当然是直接测定,但试验设计的是观察细胞内代谢的变化,所以没有为了测定CO2而改变实验条件。

      • 家园 R是8.314,温度换算成用开尔文也是对的

        关键不知道兄弟这个实验是什么来路。要是照着文献做论文,窃以为反应条件和路线不可尽信,还是如楼上驴兄的建议来得妥当。

        居庸硕士是学应用化学搞自组装杂化材料的,实验室三年深受大忽悠论文之害,而且不但国人,连鬼子在NATURE、SEINCE上的文献都TMD有放卫星滴.....

        而且坦率的说,我最后毕业的PAPER,挤挤水,冲一遍长安街没问题了...木办法啊....

        关键词(Tags): #实验
        • 家园 谢谢!

          谢谢!计算的目的是想评估一下试验是否和14C的结果相当,如果按照PV=NRT算,偏高了一些,但基本可以接受。13CO2 APE的结果很好,可以用这个比例来表述试验结果。

      • 家园 是做C13标记啊,

        我还以为那位老大的小孩到这里来骗作业答案了呢.

        理论计算确实可以,但是用于实验是不可以的.因为这些理论计算依赖于许多假设.

        叫我来做,就搞两批培养试管,但其中一批不放细胞,平行实验,测定结果,对数据作统计分析,应该可以得到你想要的结果.

        主要的误差来自两批试管的不一致,但批次足够大时实验误差应该在可以容忍的范围.

    • 家园 条件不是很清楚,

      那1毫升的缓冲液应该是加进去的时候为24毫M,PH7.4吧,按理说气体中有CO2的时候,PH不会大于7的.

    • 家园 NaHCO3水溶液HCO3根分解的温度是65℃

      只算空气的CO2就可以了。

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