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主题:【求助】有谁对农业/生物领域与计算机的边缘学科有所了解的 -- 人间重晚晴

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  • 家园 【求助】有谁对农业/生物领域与计算机的边缘学科有所了解的

    请问河里的高人们,现在有没有农业或者生物领域里与计算机交叉的一些应用或者研究的方向啊?

    偶是学通信/计算机的,想朝这个方向涉猎一下,看看有没有前景。望高人指点~~~~

    在下先行谢过了。呵呵

    • 家园 之前在期刊网上找关键词,农业信息化和精准农业。

      依稀记得目前我国农业用水效率为20-30%,化肥使用效率为30%左右。有时同样一亩地,水分含量相差比较大。目前我国农业种植品种和面积统计还主要靠农业部遥感中心。农业信息化这块还挺落后的,尤其是我们人多、地少、水少、资源少。农业现代化离不开信息化。

    • 家园 国内还是国外?

      国内的话,可以去看看华大基因搞的东西;国外可以看看Broad Institute, UCSC Bioinformatics Group, 或者23&me 这样的公司。前景还说不准,不过这些年的投入还是挺猛的。

      我同意楼下的看法。搞这些东西,数学和统计还是必不可少的。有这个基础,就可以作些复杂的数据分析。否则就是个普通程序员,没什么出头之日,不如留在通信这个行业。

    • 家园 你数学好不?搞图像处理么?

      我搞生医工的,全是玩计算机和数学的。

      医疗影像处理上有个热点,segmentation.你数学好的话,可以干干这个。医疗信息系统也很热门,不过就比较低级了,普通的搞软件没什么其他知识的都能干。

      • 家园 现在segmentation用什么方法?

        十几年前搞过图像处理,当时做分割用过Edge Detection,region growing, 和SOM,印象中region growing的效果好一点。现在有点什么新技术呢?

        • 家园 报告前辈!

          现在开始流行maximum expectation,具体细节上和support vector machine有些相似。不过大部分研究还是用的老办法来骗funding。

          可惜俺不是搞这个的,俺做sensor optimization,其中不少知识和pattern recognition有大的联系。

          • 家园 不敢当不敢当

            当初也是我们老板骗funding我做个小走狗而已。感觉EM和SVM,NN这些东西都是些大筐,什么都能往里装。

      • 家园 不懂数学和统计,千万别搞和生物建模有关系的工作

        我就干这行的。本科是应用数学,毕业设计就是对传染病的传播建模分析(fractional diffusion-reaction)。现在读生医工PhD,做器官建模和分析,还有相应的设备设计。

        如果你力学或者偏微分方程方面好些的话,可以做器官建模,或者生物流体和动态系统建模。如果你熟悉统计+偏微分和分型微分的话,可以做疾病传播方面的研究。

        如果你只是懂计算机,我劝你还是放弃。我有同学当初就是computer science毕业,完了搞血管流体模型,憋了三年,还不如个数学系本科的搞得好。

        话不好听,多少是经验之谈。数学和统计不好,你懂多少computer science都是白搭。想清楚了。比如我上面举例segmentation,用的就是统计里的expectation maximum原理,当然这是最基本的。

        • 家园 兄台有些言重了,CS出身的人从事生信建模还是可行的

          生物医学工程方向和生物信息学方向看上去差别不大,其实天差地远。

          前者侧重于数学应用,对数学功底确实要求颇深,后者关注于开发计算方法解决某类生物问题,对数学也有要求。但生信方向细分下来有许多种,某些亚方向侧重于计算机应用,对数学要求相对较低。

          通信/计算机出身的可以关注信号处理在表达谱分析中的应用、设计更有效的并行计算方法、为DNA序列分析设计算法等等。但是我认为最关键的是你必须先找到自己感兴趣的科学问题,才能在生信方面真正立足。

          • 家园 搞CS算法研究的其实就是搞数学

            国内早期计算机系的教授,多半是搞数学出身,另外少半是无线电专业的。

            • 家园 一直没搞明白为什么无线电专业出身的会来搞生信

              总感觉这两个方向似乎很难搭上关系

              我大学里一个老师原本是中科大少年班学无线电专业的,居然跑来搞生信,还做出不少成绩。对于他的心路历程,一直让我们匪夷所思。

              • 家园 东南和重大的医电专业好像都是从无线电系起家的

                就业的话去医疗器械企业也不错,迈瑞不是挺好吗。

              • 家园 转行很正常的

                搞无线电的数理基础应该不错,特别是信号处理那块,在生物数据分析上还算有点用。比如microarray数据中有个很有名的Spellman's yeast cell-cycle dataset,发在NCS的,他们就是用傅立叶变换来处理数据。如果是搞机械那一类,恐怕更不搭界。

                我本科搞人工智能,读博时跑去搞Neuroscience了。当时想反正是智能,人工的跟天然的应该也差不多,后来才发现根本是两回事。怎么办,只能硬着头皮上了。不管怎么样,有点数学功底发文章总是容易些。

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