主题：【原创】这是真的吗？Maxipreps concentration＝4163.1ng/ul？！ -- 大鹏翔宇
家园 Bioinformatics 我一个天才的高中同学现在就在费城搞这玩意呢。
原理看明白了，不过，如果city1和2自己就互补上了咋办？有什么办法避免吗？
家园 This is not Bioinformatics, Computer Made from DNA and Enzymes:
A year ago, researchers from the Weizmann Institute of Science in Rehovot, Israel, unveiled a programmable molecular computing machine composed of enzymes and DNA molecules instead of silicon microchips. Now the team has gone one step further. In the new device, the single DNA molecule that provides the computer with the input data also provides all the necessary fuel.
家园 四年前我的生物老师也是拿这个例子回复我的 当时我提出了个设想，以DNA氢键断裂能量为计算媒介代替0和1，以蛋白质为输出方式的并行式生物计算机。
不知莲兄可否看过刘慈新的《天使时代》，与这个思路正好相反。
家园 莫哈莫哈，脸怎么红了？能不能讲讲“making computer chips。。”？ 家园 精神焕发, 请看楼上.
家园 莲兄啊，看了我万分惶恐。 您哪里老了吗？！
我这个新兵还得向您多请教关于我课题的选择呢！
再说咱这门本来就没有新老一说，活到老学到老，很正常啊，毛主席他老师的教导嘛！
家园 建议酶切鉴定一下好了 通常不会有问题。
关于浓度的问题，不用担心，用最大质粒提取试剂盒的时候，因为你是用洗脱液最后将在树脂上吸附的质粒给洗脱下来，所以，加的洗脱液的体积与最后的浓度直接相关。我们用150毫升菌液提取的时候，大体上可以回收到1.5-3毫克的DNA,如果用1毫升洗脱液，那么最后的浓度一般为1.5-3毫克每毫升。没什么奇怪的。如果用的洗脱液浓度体积进一步缩小，浓度也会相应提高。
理论上，最大质粒提取试剂盒每一支可以最大吸附7毫克的DNA。只不过一般很难见到罢了，我曾经用250毫升菌液得到过5毫克每毫升的浓度。
这次也许是你这次人品坚挺（呵呵），加油，好好干！
家园 这种问题建议去丁香园 不过，有些问题好像说没太明白。你做maxprep的细菌液是多少？
跑电泳时候好像应该先酶切的，内切酶是什么，可以和酶切图谱多做几个切点的检测，图谱对了就行。
检测浓度的操作有没有问题，测了几次，稳定么？
另外，具体含义理解了，那些单词不知道中文也罢，因为你看文献9层以上用到的是英文。
家园 丁香园是哪里？我觉得河里大牛更多啊 牛剑麻省斯坦福，大牛真多啊
细菌液浓度没量，因为看上去很浑浊。
酶切没作，因为有四重的安比西林筛选，估计不会有污染。
检测的时候在别人指导下就做了一次，但样品经过充分搅拌，据他们说Nanodrop的精度很高不用取平均值。
谢谢您的指教，我是想将来要回国教学生的时候怎么办？
家园 才发现这个 检测的时候在别人指导下就做了一次，但样品经过充分搅拌，据他们说Nanodrop的精度很高不用取平均值。我的经验是如果你检测的方法出现问题，几次的结果应该相近，如果有较大的变化，那你的手法有问题。
家园 My opinion 细菌液浓度没量，因为看上去很浑浊。If this is your first time do this, better do it in a quantitative way. For example, you can measure OD600 to quantify the amount of E coli before extract the plasmid.
酶切没作，因为有四重的安比西林筛选，估计不会有污染。This is not quite safe since you may have other plasmid that using the same antibiotic selection. Better do a double digestion to confirm it.
检测的时候在别人指导下就做了一次，但样品经过充分搅拌，据他们说Nanodrop的精度很高不用取平均值。Do not trust the instrument blindly. As a matter of fact, the smaller the sample size, the larger the experimental error it tend to be. Since you are not limited by the sample amount, I would suggest to measure the UV absorption on a regular UV-Vis spectrometer with proper dilution - get absorption at 260-280 nm in between 0.1-0.8 absorbance on most instruments. Don't forget the blank, it is also very important. I would use the same buffer you used to disolve plasmid in the same cuvette to measure blank. Subtract this blank from the spectrum you measured for your plasmid solution.
I did not do molecular cloning for a long time. But 260/280=1.91 is off a little bit for double strand DNA in my memory (It shows the purity of your DNA sample).
它的大小是与质粒图一致的,不过切开看看还是有必要的，谢谢Plasmid can adopt perfect super-coil structure, it can be also nicked so that it will adopt open circle or even linear conformation. Different conformation of plasmid has different mobility rate. This is why you need to digest it in order to compare the size.
